O AEMC adota como unidade de tempo letivo os 60 minutos no 1.º ciclo e os 50 minutos nos 2.º e 3.º ciclos. Estas unidades poderão ser ligeiramente ampliadas, até 70-75 minutos, com vista a facilitar e promover o desenvolvimento de aulas práticas e de projetos, quando for completamente esclarecida a sua exequibilidade.
O AEMC opta por organizar o funcionamento de todas as disciplinas de um modo anual, possibilitando, contudo, a lecionação semestral das disciplinas com menor carga horária.

No 1.º ciclo, o AEMC tem como oferta complementar de frequência obrigatória, a componente curricular ABC Digital, em todos os anos de escolaridade. A título de enriquecimento curricular de inscrição facultativa, o AEMC oferece Atividade Física e Desportiva em todos os anos, Atividades Lúdicas e Expressivas nos 1.º e 2.º anos e Ciências Experimentais nos 3.º e 4.º anos. Nas turmas de ensino da Música, o enriquecimento curricular é preenchido com disciplinas de Formação Musical, Classes de Conjunto e Instrumento.

Nos 2.º e 3.º ciclos, para evitar uma maior pulverização curricular e uma maior carga horária, o AEMC não tem oferta complementar, exceto nas turmas do 3.º ciclo do ensino articulado da Música, onde se inclui a Introdução às Técnicas de Composição, e no 9.º ano, onde se mantém uma disciplina complementar à Matemática até que os resultados desta disciplina sejam, consistentemente, superiores à média nacional.

Em termos de apoio ao estudo no 2.º ciclo, o AEMC oferece um tempo no 5.º ano dedicado a atividades dinamizadas pela secção de Português e pela biblioteca escolar e um tempo no 6.º ano dedicado à exploração de jogos matemáticos e à resolução de problemas.

O complemento à educação artística no 2.º ciclo é preenchido com a componente curricular MatematicArte, de frequência obrigatória, com a carga horária de um tempo semanal em ambos os anos, e visando o desenvolvimento de temas e conteúdos de Matemática e de Educação Visual, fundindo as linguagens próprias destas disciplinas.
O complemento à educação artística no 3.º ciclo é preenchido por disciplinas das áreas das artes visuais, da dança, da música, do teatro ou do cinema, conforme os recursos humanos disponíveis.